Знамя имеет сложную структуру. Эта структура состоит из самого знамени и дополнительных элементов, которые являются своего рода подсказками исполнителю.
Знамена определяют только длительность звуков, направление мелодии и характер звучания: высоту же звуков показывают особые дополнительные знаки (пометы), которые бывают "киноварными" (красными) и "тушевыми" (черными). Тушевые признаки использовались для обозначения высоты звуков в знаменной нотации.
Знаменное пение основано на звукоряде, состоящем из 12-ти звуков, которые делятся на четыре "согласия". Признаки обозначают к какому согласию относится знамя. Пометы, поясняющие характер исполнения, называются указательными.